Согласно списку растений в рамках государственного задания по состоянию на 1 июля 2024 года и дендрологическому паспорту территории ГБУК «Сахалинский зооботанический парк» (подготовлен старшим научным сотрудником СФ БСИ ДВО РАН В.В. Шейко), растительный мир представлен 110 видами, среди которых имеются деревья и кустарники, внесённые в Красные книги России и Сахалинской области:

- Орех айлантолистный, тис остроконечный, сосна густоцветковая или могильная и самшит вечнозеленый / Красная книга России;

- Вишня Саржента (сахалинская) и аралия высокая / Красная книга Сахалинской области;

- Ель колючая;
- Ива ломкая;
- Ива вавилонская;
- Ива пятитычинковая;
- Кедровый стланик;
- Клён приречный;
- Жимолость синяя;
- Ива сахалинская;
- Пузыреплодник калинолистный краснолистный сорт;
- Ель аянская;
- Ольха волосистая;
- Сирень обыкновенная;
- Форзиция яйцевидная сортовая;
- Чубушник венечный;
- Сирень Мейера;
- Бересклет тёмно-багряный;
- Берёза плосколистная;
- Вишня ниппонская;
- Жимолость каприфоль;
- Конский каштан обыкновенный;
- Девичий виноград пятилисточковый;
- Дуб крупнопыльниковый;
- Калина гордовина;
- Гортензия крупнолистная;
- Боярышник Дугласа;
- Бирючина обыкновенная;
- Лимонник китайский;
- Ива Матсудана;
- Сирень венгерская;
- Крыжовник обыкновенный;
- Пихта сахалинская;
- Слива колючая или тёрн;
- Крыжовник растопыренный;
- Смородина каменная;
- Смородина альпийская;
- Сирень Комарова;
- Калина обыкновенная Бульденеж;
- Сирень юньнаньская;
- Гортензия метельчатая сортовая;
- Туя западная;
- Вейгела цветущая;
- Форзиция яйцевидная;
- Рябина смешанная;
- Туя западная «Globosa»;
- Берёза аллеганская;
- Туевик долотовидный;
- Роза сортовая;
- Черёмуха виргинская;
- Снежноягодник белый;
- Спирея серая;
- Спирея японская желтолистный сорт;
- Спирея японская с красными верхушками;
- Барбарис Тунберга;
- Барбарис Тунберга пурпурный сорт;
- Пузыреплодник калинолистный зеленовато-желтолистный сорт;
- Сосна корейская;
- Спирея японская золотистый сорт;
- Ива пурпурная;
- Спирея японская;
- Жимолость ложнозолотистая;
- Багульник наибольший;
- Клён Майра;
- Свидина белая;
- Берёза Эрмана;
- Дуб курчавенький;
- Смородина широколистная;
- Барбарис Тунберга колонновидный сорт;
- Свидина белая белоокаймленный сорт;
- Спирея японская «Little Princess»;
- Вишня Максимовича;
- Малина сахалинская;
- Рябинник sp.;
- Лещина маньчжурская;
- Шиповник Федченко;
- Шиповник морщинистый «Hansa»;
- Барбарис восточный;
- Облепиха крушиновидная;
- Чебушник Гордона колумбийский;
- Чебушник венечный природный;
- Смородина черная;
- Дуб черешчатый;
- Липа sp.;
- Клён зеленокорый;
- Айвочка «Amfora»;
- Пузырплодник калинолистный «Lutea»;
- Сирень амурская (трескун амурский);
- Ольховник sp.;
- Ива пурпурная белопятнистый сорт;
- Берёза плакучая;
- Спирея sp.;
- Спирея японская «Alpina»;
- Спирея sp.;
- Спиреей Фрича;
- Бересклет крылатый;
- Дрок красильный;
- Барбарис Зибольда;
- Вишня Максимовича обильно цветущая форма;
- Вишня Бессея;
- Боярышник кроваво-красный;
- Груша sp.;
- Яблоня Шейдекера «Плакучая»;
- Яблоня пурпурная;
- Ильм лопастый.